|
|
A |
C |
D |
E |
F |
G |
H |
I |
K |
L |
M |
N |
P |
Q |
R |
S |
T |
V |
W |
Y |
gap |
|
Q |
-1.00 |
-3.00 |
0.00 |
2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
0.00 |
-3.00 |
1.00 |
-2.00 |
0.00 |
0.00 |
-1.00 |
5.00 |
1.00 |
0.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-1.00 |
1.00 |
|
Q |
-1.00 |
-3.00 |
0.00 |
2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
0.00 |
-3.00 |
1.00 |
-2.00 |
0.00 |
0.00 |
-1.00 |
5.00 |
1.00 |
0.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-1.00 |
1.00 |
|
E |
-1.00 |
-4.00 |
2.00 |
5.00 |
-3.00 |
-2.00 |
0.00 |
-3.00 |
1.00 |
-3.00 |
-2.00 |
0.00 |
-1.00 |
2.00 |
0.00 |
0.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
K |
-1.00 |
-3.00 |
-1.00 |
1.00 |
-3.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-3.00 |
5.00 |
-2.00 |
-1.00 |
0.00 |
-1.00 |
1.00 |
2.00 |
0.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
T |
0.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
0.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
1.00 |
5.00 |
0.00 |
-2.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
C |
0.00 |
9.00 |
-3.00 |
-4.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
Y |
-2.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
3.00 |
-3.00 |
2.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-1.00 |
2.00 |
7.00 |
1.00 |
|
A |
4.00 |
0.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-2.00 |
0.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
1.00 |
0.00 |
0.00 |
-3.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
C |
0.00 |
9.00 |
-3.00 |
-4.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
G |
0.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-3.00 |
6.00 |
-2.00 |
-4.00 |
-2.00 |
-4.00 |
-3.00 |
0.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-2.00 |
0.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
-3.00 |
1.00 |
|
T |
0.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
0.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
1.00 |
5.00 |
0.00 |
-2.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
A |
4.00 |
0.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-2.00 |
0.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
1.00 |
0.00 |
0.00 |
-3.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
G |
0.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-3.00 |
6.00 |
-2.00 |
-4.00 |
-2.00 |
-4.00 |
-3.00 |
0.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-2.00 |
0.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
-3.00 |
1.00 |
|
H |
-2.00 |
-3.00 |
-1.00 |
0.00 |
-1.00 |
-2.00 |
8.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-2.00 |
1.00 |
-2.00 |
0.00 |
0.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
2.00 |
1.00 |
|
L |
-1.00 |
-1.00 |
-4.00 |
-3.00 |
0.00 |
-4.00 |
-3.00 |
2.00 |
-2.00 |
4.00 |
2.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-1.00 |
1.00 |
-2.00 |
-1.00 |
1.00 |
|
V |
0.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-3.00 |
3.00 |
-2.00 |
1.00 |
1.00 |
-3.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
0.00 |
4.00 |
-3.00 |
-1.00 |
1.00 |
|
R |
-1.00 |
-3.00 |
-2.00 |
0.00 |
-3.00 |
-2.00 |
0.00 |
-3.00 |
2.00 |
-2.00 |
-1.00 |
0.00 |
-2.00 |
1.00 |
5.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
D |
-2.00 |
-3.00 |
6.00 |
2.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-4.00 |
-3.00 |
1.00 |
-1.00 |
0.00 |
-2.00 |
0.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-4.00 |
-3.00 |
1.00 |
|
C |
0.00 |
9.00 |
-3.00 |
-4.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
P |
-1.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-4.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-2.00 |
-2.00 |
7.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-4.00 |
-3.00 |
1.00 |
|
S |
1.00 |
-1.00 |
0.00 |
0.00 |
-2.00 |
0.00 |
-1.00 |
-2.00 |
0.00 |
-2.00 |
-1.00 |
1.00 |
-1.00 |
0.00 |
-1.00 |
4.00 |
1.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
S |
1.00 |
-1.00 |
0.00 |
0.00 |
-2.00 |
0.00 |
-1.00 |
-2.00 |
0.00 |
-2.00 |
-1.00 |
1.00 |
-1.00 |
0.00 |
-1.00 |
4.00 |
1.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-2.00 |
1.00 |
|
P |
-1.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-4.00 |
-2.00 |
-2.00 |
-3.00 |
-1.00 |
-3.00 |
-2.00 |
-2.00 |
7.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-1.00 |
-1.00 |
-2.00 |
-4.00 |
-3.00 |
1.00 |
|
N |
-2.00 |
-3.00 |
1.00 |
0.00 |
-3.00 |
0.00 |
1.00 |
-3.00 |
0.00 |
-3.00 |
-2.00 |
6.00 |
-2.00 |
0.00 |
0.00 |
1.00 |
0.00 |
-3.00 |
-4.00 |
-2.00 |
1.00 |
Matrix
2. Frequency matrix for the query sequence QQEKTCYACGTAGHLVRDCPSSPN.